Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBIS)

ibis

El IBIS fue creado el 24 de Marzo de 2006 en virtud de un convenio firmado por la Consejería de Salud de la Junta de Andalucía, la Consejería de Innovación, Ciencia y Empresa de la Junta de Andalucía, el Servicio Andaluz de Salud, la Universidad de Sevilla, y el Consejo Superior de Investigaciones Científicas.

 

Los institutos de investigación sanitaria son entidades dedicadas a la investigación básica y aplicada, creadas mediante la asociación de los hospitales del Sistema Nacional de Salud, las universidades, organismos públicos de investigación y otros centros públicos o privados de investigación, a los efectos de constituir institutos de investigación multidisciplinares y multiinstitucionales.

El IBiS se define como instituto de investigación, bajo un modelo de centro mixto y cooperativo entre las entidades firmantes. En el expositivo Sexto del Convenio de Creación del IBiS, se indica que dichas entidades “crean un instituto de investigación en biomedicina, de los previstos en el Real Decreto 339/2004, de 27 de febrero, sobre acreditación de institutos de investigación sanitaria”.

El IBiS representa la continuidad de un proyecto iniciado con la creación, en el año 2000, del Laboratorio de Investigaciones Biomédicas, en adelante LIB. Tanto en el acuerdo de creación del LIB del año 2000 como en el convenio de creación del IBiS del año 2006, se destaca como aspecto clave y estratégico la ubicación de dichos centros en el Campus del Hospital Universitario Virgen del Rocío, ya que se postula, como objetivo prioritario de ambos, el desarrollo de la investigación biomédica traslacional.

El IBiS fue acreditado por el Instituto de Salud Carlos III en marzo de 2009 y reacreditado en abril de 2014. La acreditación como instituto de investigación sanitaria es un reconocimiento de la excelencia de los resultados científicos y de los retornos beneficiosos (sanitarios, sociales y económicos), producto de la labor investigadora en el entorno hospitalario.

Objetivos 

El IBiS se concibe como un espacio de investigación biomédica multidisciplinar, situado dentro del Campus del Hospital Universitario Virgen del Rocío, complejo hospitalario regional de Andalucía con un alto nivel asistencial, docente e investigador, siendo su objetivo llevar a cabo una investigación competitiva de nivel internacional sobre las causas de las patologías de mayor prevalencia entre la población y el desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico y tratamiento para las mismas.

El principio básico que sustenta este modelo es el contacto y la colaboración íntimas de la investigación experimental con el sistema de asistencia sanitaria y docencia a profesionales postgraduados. De esta forma se garantiza la traslación efectiva de los resultados de investigación en términos de beneficios para la salud de los ciudadanos, tanto de manera directa: mejora en la prevención, diagnóstico, tratamiento y seguimiento de las enfermedades, como indirecta: facilitando la cooperación con las empresas farmacéuticas y biotecnológicas.

El IBiS se basa en la investigación fundamental, a nivel molecular o celular, con el objetivo de la transferencia inmediata de los conocimientos a la realidad clínica y al desarrollo de nuevas terapias.

Esta investigación traslacional, una de las características genuinas del IBiS, sólo es posible en estructuras que combinan en un mismo lugar la medicina molecular con la práctica clínica de calidad, potencia además la investigación de calidad clínica y epidemiológica.

Las entidades impulsoras y creadoras del IBiS buscan, a su vez, promover desde el mismo la coordinación de las investigaciones biomédicas que se realizan en la Comunidad Autónoma Andaluza, potenciando la colaboración y cooperación con otros centros y equipos de investigación, con los siguientes objetivos estratégicos:

  • Contribuir a mejorar la salud de la ciudadanía a través de la generación de conocimiento y la innovación.
  • Desarrollar una investigación de excelencia, tanto básica como clínica y de salud pública.
  • Promover la calidad y seguridad de los procesos de investigación.
  • Generar una metodología de trabajo colaborativo y cooperativo entre los grupos de investigación.
  • Promover la formación de investigadores, así como el intercambio de los mismos entre centros de investigación, con el objetivo de facilitar el encuentro y puesta en común de conocimientos que redunden en beneficio del avance del conocimiento.
  • Promover la cooperación y colaboración con otros centros e investigadores autonómicos, nacionales o extranjeros, mediante la constitución y participación en redes temáticas de investigación relacionadas con su campo de actuación.
  • Contribuir al uso eficiente de las estructuras y recursos disponibles para la investigación.
  • Velar porque la investigación, en la que participe directa o indirectamente, se desarrolle bajos los criterios de calidad y respecto de los criterios éticos recogidos en los convenios internacionales en materia de biomedicina a los que se haya adherido la comunidad autonómica andaluza o España.
  • Consolidar el Instituto como el centro de referencia de la investigación biomédica del sur de Europa.
  • Promover la colaboración institucional en la investigación biomédica, con el objetivo de conseguir mejores resultados y con más altas cotas de eficiencia al coordinar a los investigadores.
  • Establecer mecanismos de colaboración entre los diferentes agentes del Sistema Andaluz del Conocimiento, especialmente aquellos radicados directamente en su entorno, para el desarrollo de los proyectos que se lleven a cabo en el Instituto.
  • Incorporar la transferencia de resultados, como parte inseparable del sistema de gestión del conocimiento generado a través de la investigación, con el objetivo de que consiga tener un impacto positivo en la salud de la ciudadanía.
  • Desarrollar una política activa de búsqueda de financiación, con el objetivo final de garantizar la sostenibilidad del Instituto.
  • Organizar, asesorar o financiar reuniones científicas, congresos, seminarios y otras actividades similares cuya temática esté relacionada con la investigación en su campo de actividad.
  • Promover actuaciones de tutela en centros y grupos emergentes de investigación que desarrollen su labor en el IBIS o en su entorno.
  • Líneas de investigación  Enfermedades Infecciosas y del Sistema Inmunitario
  • Las actividades de estos grupos se encuentran en los campos de las enfermedades infecciosas y la respuesta inmunitaria contra la enfermedad, incluida la metodología de Epidemiología Clínica y Molecular y la Investigación Básica y Traslacional. La composición multidisciplinar del grupo permite la inclusión de proyectos sobre las infecciones bacterianas, fúngicas y virales, y en huéspedes inmunocompetentes e inmunocomprometidos. La mayor parte de los grupos del área están involucrados en la investigación básica o en la traslacional, aunque alguno de los grupos están dirigidos por investigadores clínicos. En concreto, varios grupos están interesados en el estudio de la neurodegeneración, la neuroinflamación y fenómenos relacionados. El objetivo de estos grupos es el de analizar el impacto de los procesos involucrados en el envejecimiento del cerebro, así como en las enfermedades de Parkinson y Alzheimer. Otros temas de interés en el Área son el estudio de las modificaciones genéticas (particularmente canalopatías) subyacentes a patologías neuronales (por ejemplo, epilepsia) y las bases moleculares de la respuesta neuronal a la hipoxia. El cáncer afectará aproximadamente a una de cada 3 personas en algún momento de su vida y, mejorar su prevención, el diagnóstico y el tratamiento sigue siendo un reto importante para la ciencia médica. Colectivamente, los grupos que trabajan en este ámbito tienen como objetivo reducir la brecha entre la investigación de cáncer básica y la práctica clínica a través de la investigación innovadora e interdisciplinaria en tres campos principales: la biología, el diagnóstico y el tratamiento del cáncer. El interés de los grupos del área se centra en diferentes aspectos de la fisiopatología cardiovascular (incluyendo cardiopatía isquémica y la enfermedad cardíaca coronaria, cardioprotección, factores de riesgo vascular y la fisiología del músculo liso vascular), así como en la comprensión de los mecanismos que subyacen a la regeneración de células pancreáticas del adulto. Abordan estos objetivos utilizando enfoques funcionales, celulares y moleculares. El objetivo final es diseñar nuevas estrategias terapéuticas para las enfermedades cardiovasculares y la diabetes. El desarrollo de una investigación biomédica de calidad precisa de una estructura bien organizada de equipamientos e infraestructuras científicas que proporcionen a los investigadores el soporte técnico y metodológico avanzado que necesitan.
    • Las Unidades para la prestación de servicios comunes de apoyo a la investigación (USCAIN) del Instituto de Biomédica de Sevilla (IBiS) están organizadas en 12 unidades técnicas y una de apoyo metodológico a la investigación, contando asimismo con 3 plataformas: 
    •  Unidades de servicios comunes de investigación biomédica (USCIN)
    •  Patología cardiovascular y Respiratoria. Otras patologías sistémicas
    • Oncohematología y Genética
    • Otros grupos están trabajando en la neuroprotección y en el desarrollo de nuevas estrategias basadas en células para el tratamiento de enfermedades neurodegenerativas.
    •  Neurociencias
    • Esta área consta de grupos con intereses científicos y experiencias complementarias, como clínicos de enfermedades infecciosas, microbiólogos, inmunólogos y biólogos. Los grupos son dirigidos por investigadores clínicos, casi la totalidad profesionales del Hospital Universitario Virgen del Rocío y varios profesores/catedráticos de la Universidad de Sevilla.
    • El IBiS ha priorizado sus líneas de investigación al definir, mediante un documento de PRIORIZACIÓN DE LÍNEAS, aprobado por el Consejo Rector, que debe ser un espacio multidisciplinar donde se realice una actividad centrada especialmente en las áreas temáticas que se destacan por atender a las patologías más prevalentes en la población, siendo estas:

Servicios Científico-Tecnológicos/ Plataformas

Breve descripción / Cartera de Servicios

Bioinformática y Biología Computacional

  • Técnicas de Análisis de expresión en distintos organismos modelos (RNA- Seq o microarrays)
  • Técnicas de Análisis de Proteínas de unión a ADN (Chip-Seq)
  • Análisis funcionales
  • Técnicas de análisis de PCR cuantitativa (RT-qPCR)

Citómica y Citometría de Flujo y Separación Celular

Técnicas Citométricas

  • Inmunofenotipaje celular
  • Análisis de ciclo celular, proliferación y apóptosis
  • Separación de poblaciones celulares mediante citometría de flujo (cell sorting)
  • Análisis multiplexado
  • Análisis de micropartículas
  • Cinéticas
  • Experimentos funcionales (medida de ROS)

Soporte Técnico

  • Soporte en la planificación experimental
  • Cursos de iniciación a la citometría

Cultivos Celulares

El Servicio de Cultivos Celulares consta de 9 salas de nivel de contención 2 provistas de:

  • 9 frigoríficos y 9 congeladores
  • 23 cabinas de Seguridad Biológica tipo 2 con sistema de filtrado HEPA
  • 3 cabinas de flujo laminar
  • 37 incubadores de CO2
  • 5 incubadores de CO2/O2
  • 9 microscopios invertidos
  • 9 centrífugas refrigeradas con rotor basculante con adaptadores para tubos de 2, 10, 15 y 50 ml
  • 9 baños de agua con agitación
  • 9 agitadores tipo vórtex
  • 4 termo mezcladores

Esterilización y limpieza

Los técnicos de esta Unidad se ocupan de la recogida, procesado, limpieza, esterilización y distribución del material de vidrio, plástico o de cirugía. Para ello disponen del siguiente equipamiento:

  • 6 agitadores magnéticos calefactados
  • 2 baños sonicadores ultrasonido
  • 4 autoclaves y accesorios
  • 4 termodesinfectadoras y accesorios
  • 2 agitadores tipo vórtex
  • 4 balanzas analíticas
  • 2 balanzas de precisión
  • 6 estufas de secado
  • 4 PH metros 
  • 1 Osmómetro
  • 2 productores de agua ultrapura
  • 1 campana de flujo laminar 
  • 1 estufa para mantenimiento de medios 
  • 4 productora de hielo en escamas 

Genómica y secuenciación

  • Mass ARRAY  (SEQUENOM; actividad post-PCR)
  • Aplicaciones: genotipado, análisis de metilación y análisis de expresión de genes conocidos
  • Applied Biosystems 3500 Genetic Analyzer (Applied Biosystems)
  • Aplicaciones: secuenciación de DNA y análisis de fragmentos (MLPA y microsatélites) por electroforesis capilar
  • Plataforma GeneChip (Affymetrix)
  • Análisis micro RNA (Perfiles de expresión mRNA)
  • Análisis calidad RNA (Bioanlyzer Agilent)
  • Síntesis de DNA
  • Hibridación y análisis de chips

Grandes aparatos

  • Captura de imágenes por quimioluminiscencia, fluorescencia y fosforescencia
  • Centrifugaciones y ultracentrifugaciones de muestras
  • Análisis de proteómica
  • Estudios de expresión de genes por PCR a tiempo real
  • Ultraconservación de muestras biológicas
  • Detección de fluorescencia por microscopía
  • Secuenciación
  • Cuantificación de ácidos nucleicos y proteínas
  • Otras técnicas de apoyo tales como liofilización, sonicación, desecación por
  • vacío, etc…

Histología

Procesamiento de muestras en parafina

  • Procesamiento y control del procesador automático de tejidos
  • Descalcificación de muestras
  • Procesamiento completo de inclusión en parafina
  • Corte seriado en micrótomo y montaje de tejidos
  • Desparafinado de cortes, realización de tinciones
  • Deshidratación y montaje de portaobjetos

Procesamiento de muestras en congelación

  • Preparación de bloques por congelación
  • Cortes seriados de bloques por congelación y recogida de cortes en portaobjetos o en flotación
  • Tinción de los cortes por congelación
  • Preparación de muestras para cortes en vibratomo
  • Cortes seriados de muestras en vibratomo y montaje

Perfusión de animales

Tinciones

  • Hematoxilina - Eosina
  • Tricrómico de Masson
  • Nissl

Técnicas Citoquímicas e Inmunohistoquímicas

Imagen Diagnóstica

Ecógrafo VEVO 2100

  • Estudios de Abdomen
  • Estudios Cardiovasculares
  • Patología Vascular
  • Imagen 2D
  • Estudio de movilidad de estructuras con Modo M
  • Estudio de flujos con método Doppler

Resonancia Magnética ICON 1Tesla

  • Estudios en enfermedades neurológicas
  • Enfermedades cardiovasculares
  • Anatomía de cuerpo completo e identificación de tumores
  • Imágenes en 2D en planos Axial, Coronal y Sagital
  • Técnicas específicas tras la introducción vía intraperitoneal de Gadolinio

Laboratorio de usos múltiples

Técnicas de Análisis de ADN/ARN

  • Purificación y preparación de muestras para secuenciar
  • Extracción de Ácidos Nucleicos
  • Electroforesis y migración de ADN
  • Reacción de PCR cualitativa
  • RT-PCR a tiempo real cuantitativa
  • Análisis de restricción y clonación molecular
  • Análisis calidad RNA, DNA (BIOANALYZER 2100 AGILENT)

Técnicas de análisis de proteínas

  • Extracción de proteínas
  • Análisis mediante Western Blot
  • Estudios colorimétricos (Elisa)
  • Análisis calidad de extractos de proteínas (BIOANALYZER 2100 AGILENT)

Microscopía óptica y confocal

  • Microscopía Óptica y de Fluorescencia
  • Microscopía Confocal
  • Sistema de Super-Resolución
  • Microscopía para Estereología

Producción y experimentación animal

  • Mantenimiento de ratón y rata tanto en condiciones convencionales como spf
  • Mantenimiento de ratones transgénicos
  • Mantenimiento de ratones inmunodeprimidos
  • Producción de rata Wistar
  • Producción de ratón consanguíneo y no consanguíneo
  • Rederivación de líneas de ratón: por cesárea o embrionaria
  • Laboratorio de comportamiento
  • Laboratorio de imagen (Resonancia Magnética)
  • Área de hipoxia
  • Irradiador
  • Cirugía de animal grande
  • Microcirugía y cirugía laparoscópica
  • Actividades de formación

Proteómica

  • Separación de extractos proteicos por electroforesis bidimensional
  • Análisis de la expresión diferencial de proteínas por electroforesis bidimensional con fluoróforos premarcados (2D-DIGE)
  • Identificación y caracterización de proteínas por huella peptídica
  • Identificación de proteínas en muestras complejas
  • Identificación de modificaciones postraduccionales en proteínas
  • Cuantificación y análisis de la expresión de proteínas mediante marcaje isobárico diferencial iTRAQ 4plex, 8 plex y TMT 2 plex, 6 plex y 10 plex
  • Cuantificación de proteínas completas mediante aqua-péptidos
  • Proteómica dirigida. PRM (Paralell reaction monitoring)
  • Proteómica de interacción proteína-ligando

Puede consultarse más información en www.ibis-sevilla.es